FFU缺點：

(1)要求回風(fēng)道全部阻力(包括多孔地板、格柵及風(fēng)道)、干表冷器阻力及末級過濾器的阻力(在初阻力時)，總共應(yīng)控制在165Pa左右，以滿足運行時大阻力在250Pa以內(nèi)。因此干表冷器的傳熱面積要較大，回風(fēng)道尺寸亦要較大，多孔地板及格柵等的阻力要小，一般作法是：控制干表冷器阻力在50Pa左右，回風(fēng)道阻力在15Pa以內(nèi)，否則就需要再增設(shè)加壓風(fēng)機系統(tǒng)，這就是降低了FFU系統(tǒng)的綜合優(yōu)點。

(2)采用DC/EC電機后，單位風(fēng)量的能耗可能比當(dāng)前一般大型離心風(fēng)機的集中系統(tǒng)為低，但已有研究指出，比采用改進后的大型軸流風(fēng)機的回風(fēng)系統(tǒng)的能耗還是要高。因此需要注意大型軸流風(fēng)機的效率提高及其系統(tǒng)的阻力降低的因素。

(3)一般FFU系統(tǒng)由于單位風(fēng)量的能耗較大，因此潔凈室工程的冷負荷亦相應(yīng)增加。